Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ERC1-213ENST00000543086 9241 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRA4-201ENST00000264318 11973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms