Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALYREFQ86V81 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALYREFQ86V81 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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