Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA3Q9Y6Q9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms