Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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