Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD2APQ9Y5K6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms