Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNSTRNQ9Y448 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms