Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms