Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P8

RCL1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCL1Q9Y2P8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCL1Q9Y2P8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms