Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms