Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SORCS3Q9UPU3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SORCS3Q9UPU3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SORCS3Q9UPU3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SORCS3Q9UPU3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SORCS3Q9UPU3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SORCS3Q9UPU3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SORCS3Q9UPU3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SORCS3Q9UPU3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SORCS3Q9UPU3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SORCS3Q9UPU3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SORCS3Q9UPU3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms