Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms