Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDRG4Q9ULP0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDRG4Q9ULP0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms