Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms