Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms