Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms