Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms