Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms