Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms