Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms