Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms