Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms