Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZP8

C1RL, Complement C1r subcomponent-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RLQ9NZP8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RLQ9NZP8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms