Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COMMD8Q9NX08 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COMMD8Q9NX08 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms