Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms