Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms