Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms