Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms