Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms