Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms