Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.1 ms