Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms