Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms