Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D4AQ9H788 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.5 ms