Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF41Q9H4P4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms