Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms