Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT23Q9C075 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms