Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms