Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms