Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms