Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms