Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA7Q9BWT1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA7Q9BWT1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms