Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms