Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms