Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TM2D3Q9BRN9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TM2D3Q9BRN9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TM2D3Q9BRN9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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