Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms