Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS1Q99742 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS1Q99742 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms