Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHP1Q99653 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms