Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP89Q96ST8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP89Q96ST8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms