Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms