Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms